** Ribosomeの構造に関して、2009年にRamakrishnan (MRC LMB Cambridge), Steitz (Yale University), and Yonath (Weizmann Institute)の3氏にノーベル化学賞が贈られました。
●構造生物学 2008年度 吉川分
11/19 Translation 1: Genetic code, tRNA, aminoacyl-tRNA synthetase
11/26 Translation 2: Ribosome structure
12/3 Translation 3: Elongation
12/10 Translation 4: Initiation, Termination
12/17 Translocation: Secretory and Membrane Proteins
●講義を理解する上で役に立つweb site/software
Protein Data Bank: 生物の分子構造を登録してあるデータベース
PyMOL: 講義で使用している分子ビューワー。Windows, Mac OS X, Linux用があります。
Translationのmovie, MRC Cambridge Ramakrishnan Lab
●講義で使用した分子:
PyMOLで開ける、pse形式で保存してあります。
11/19 Genetic code, tRNA, aminoacyl-tRNA synthetase
tRNA
tRNA-aminoacyl-tRNA synthetase complex
Leucyl-tRNA synthetaseによるtRNA Editing (11/26追加)
11/26 Ribosome structure
70S ribosome
16Sによる開始コドンの認識
12/3 Elongation
EF-Tu tRNA complex
EF-G
30S ribosome .. codon-anticodon の間の結合
12/10 Initiation, Termination
電子顕微鏡による70S ribosomeとinitiation factorの複合体を
示した論文
Terminationに関する総説
以上のリンクは、学内からアクセスすると実際の論文を見ることができます。
補遺: 大腸菌のタンパクの凡そ半数では、initiationの時に取り込まれる N-formylmethionineはリボソームから出たときに取り除かれます。Eukaryoteでも同じように、多くのタンパクで、N末端の methionineが取り除かれています。
12/17 Translocation
SecYEG complexの結晶構造
Translocationに関する総説
課題について
: いくつか日本語で解説された情報を紹介しておきます。参考にしてください。また、〆切は試験の前までとします。課題を出した方には毎週月曜日に確認のメールを
出しています。もし確認のメールが来ない場合には、再度吉川までメールをお願いします。
プリントの訂正：課題に使う1exdは、tRNA bound to glutamate aminoacyl tRNA synthetaseではなく、glutamine tRNA bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetaseです。
PDB (Protein Data Bank)について
PyMolの使い方
スクリーンショットの取り方
